肛门皲裂是最易与肛裂相混淆的一种病，皲裂发生在肛腺和肛管处皮肤的浅表开裂，裂口可发生在肛管的任何部位，多呈浅表，局限于皮下，不涉及到肌层，且裂口几处同时存在，不用牵开肛门即可见到。此表现多发生于肛门皮肤病，譬如湿疹、皮炎及肛门瘙痒症等。排便时虽有疼痛，但没有持续性痉挛性剧痛，可有手纸带血，局部常可见到丘疹、角质化和增生等皮肤病变。而肛裂多1～2个裂口，在肛管处发生，持续性剧痛，常可深达肌层。

在治疗方面，肛门皲裂多由皮肤病引起，所以，以外用药物治疗为主，而肛裂则以手术治疗为主。