患有自闭症的儿童有更高的发生癫痫危险，这显示可能二者有相同的大脑异常状况。研究者称当自闭症的儿童有精神障碍突然发生时，应该怀疑癫痫症的可能。自闭症和癫痫症表面上完全不同。

　　癫痫症是突发性的精神异常；自闭症会影响到与人交往的能力和对环境的反映能力。但是两种状况都是基于大脑的疾病，以前的研究显示自闭症和癫痫症经常是一起发生，但发生癫痫症的比自闭症的高30%。“我们知道在自闭症患者中精神障碍突发的比例更高”John Pomeroy博士说。他和他的纽约州立大学的同事根据38名年龄在1到15岁的儿童的脑电图研究了大脑的活动。他们发现14名儿童（37%）同时也有癫痫症。他们中只有2个以前有过癫痫的发作和自闭障碍的恶化。他们都属于自闭症中低机能范围，那使得发现癫痫症状很难。

　　总的来说，有癫痫症的儿童比其他儿童更容易发生惊厥，“突然眼睛发直”或自闭症状的突然恶化。尽管如此，John Pomeroy提出要谨慎对待给自闭症儿童的常规脑电图检查。除非有证据表明他们有癫痫的发作或病情的反复，在脑电图上很少能说明有癫痫症类型的大脑活动。研究者表示一些自闭症儿童表现的行为，如呼吸抑制的小发作或突然的暴怒，这些很少与癫痫相关。研究者总结说在自闭症的儿童中癫痫的发生更为常见，但是，他们补充说显示没有精神障碍突发的自闭儿童中“常规的脑电图中很难找到证据”