乳腺导管内乳头状瘤是良性肿瘤，恶变的机率不多，药物治疗效果不理想，手术是本病的最有效的治疗方法。虽然此病为良性疾病，但有些人尤其是40岁以上的患者或中小导管里的乳头状瘤，有发生恶变的可能，因此，诊断为此种疾病，应尽早安排手术。术前，应先行乳腺导管造影，这不仅有助于确定病变的性质并能为手术定位，尤其是对扪不见肿块的导管内乳头状瘤。

如为单发的乳腺导管内乳头状瘤，一般将肿瘤及受累的导管系统一并切除即可，若为多发的乳腺导管内乳头状瘤，可作这区段切除或象限切除术，不必做全乳切除术，只要切除彻底，预后良好。切下之组织均应送病理组织检查，如病理检查发现有导管上皮细胞增生活跃或有重度非典型性，可视患者具体情况，如年龄、病变范围、患者的个人意愿等，选择做全乳切除术，以防恶变。