输卵管积水的治疗有下列几种方式可为参考：

     输卵管积水的治疗1.内科疗法：针对具有输卵管积水妇女体内可能具有较高披衣菌抗体的特性，给以抗生素(doxycycline)治疗，但效果有待进一步研究评估。

     输卵管积水的治疗2.把输卵管积水以阴道超声波或腹腔镜等方式抽吸掉：有研究显示在开始打排卵针前把吸液抽掉，可以获得较好的卵巢反应即较多的植入胚胎，但究竟此步骤可否提高怀孕率，仍属争议的范围。

     输卵管积水的治疗3.在进行试管婴儿疗程前把积水的输卵管摘除：这部份亦属有争议性。既然大部分的研究显示输卵管积液对于试管婴儿的怀孕率、着床率有不好的影响，有人主张干脆把这些积水的输卵管作预防性的切除，但是有人认为不适当或过当的输卵管切除，反而或影响卵巢的血流供应，导致之后滤泡成长与卵巢荷尔蒙生成的不良影响。

    对于输卵管积水的治疗这类病人在进行试管婴儿疗程之前的作法，取决于其输卵管病变的程度，若输卵管皱褶已遭破坏，管壁不规则及管壁黏膜沾黏，有阻塞性多处病变，或是管壁已因发炎而增厚，直径1-2cm，及输卵管近子宫端形成结节状，则小心作输卵管摘除术，（尽量接近输卵管侧，远离卵巢侧），若病人预期卵巢功能不佳（年纪大于35岁，或是之前接受过卵巢手术）、腹腔沾黏致使输卵管摘除困难时，则作输卵管近端（接近子宫端）的烧灼术或阻断术或是纯粹把输卵管积水引流抽吸出来。