精子异常包括精子生成障碍和成熟障碍，为男性不孕症最常见的原因。有时虽然精子数量足够，但由于精子不成熟或形态异常而造成精子不能活动，结果不能使卵子受精。正常的精液中也可能有少部分异常的精子，这样也会减少受孕的机会。

    以下因素均可影响精子的质量和数量： 
    1、感染性疾病  如腮腺炎病毒可累及生殖道，引起发炎反应，造成?丸萎缩。大约25%青春期后患腮腺炎的男性会患不孕症。
   

     2、内分泌疾病  少部分男性不孕症（2-5%）是由于内分泌异常而引起的。最常见的原因是FSH和LH不足而影响雄性激素的分泌和精子的产生。
   

    3、免疫性疾病  有些男性会产生对抗自己精子的抗体，造成精子的活动率下降或精子凝集（精子头或尾相互连接）而造成不孕。生活环境和生活方式也会影响精子的品质。接触放射线物质和一些抗癌治疗也会造成暂时或永久性的精子生成障碍。
   

    4、生理结构异常  生理结构异常可造成生殖道的阻塞，当精液部分或完全受阻就会引起不孕。部分异常是先天性或遗传性的缺陷，而另外一些则是由于泌尿生殖系统感染或发炎，所造成生殖道手术后的疤痕形成亦会造成阻塞。精索静脉曲张也可导致精子数量减少。20%-40%的不孕症男性有阴囊静脉曲张，通常外科治疗效果很好。
   

    5、其它因素  凡是影响精子进入女性生殖道的因素都可造成男性不孕，例如阳痿或早泄。