肛瘘是由肛门局部感染所引起，同时肛瘘形成后经常有脓水外溢，肛门部潮湿难受，所以注意肛门部清洁卫生极为重要，应经常用温水泡洗肛门，最少每晚要洗一次。一则可保持局部清洁。二则可改善肛门部血液循环，增强抵抗力，减轻炎症反应。一般可用温盐水(3000毫升温水中加30克食盐)外洗，亦可选用明矾水外洗(3000毫升温水中加明矾60克)。

肛瘘发炎化脓时，如外口闭塞，可用消毒的针头挑破外口，排出脓液，既可减轻胀痛，又可预防脓液向其他部位蔓延。同时可用清热解毒的中药(黄柏15克、蒲公英10克、朴硝30克、大黄30克、地丁草15克)煎汤外洗。

如肛瘘的分泌物多时，内裤要勤换、勤洗暴晒，也可用肛门带保护肛门，以免过多污染内裤。肛门带亦要经常换洗，不要让脓液、分泌物积留患部。

中医认为肛瘘是湿热引起，所以油腻生湿的食物应有所节制，戒除烟酒、嗜茶的习惯，应多食清淡并含有较多维生素的食物，如冬瓜、丝瓜、绿豆、萝卜等。经久不愈的肛瘘多属虚寒型。饮食上宜选有健脾和胃、益气补血、含有丰富蛋白质、维生素的食品，如瘦肉、牛肉、蘑菇、大枣、芝麻等。